Während in der Vergangenheit die chirurgische Parodontaltherapie nur mit einem reparativem Ansatz zum Einsatz kam (Ausbildung einer Narbe nach chirurgischer Beseitigung einer Entzündung des Zahnhalteapparates), steht heute mit Emdogain die Möglichkeit zur Verfügung, die einzelnen komplexen Strukturen des zerstörten Zahnhalteapparates wieder zu regenerieren. Emdogain ist ein sogenanntes Schmelzmatrixprotein, dass nach Applikation auf der Wurzelobberfläche mesenchymale Stammzellen dazu anregen kann, einen neuen Zahnhalteapparat auszubilden. Dabei kann es zu Knochenregeneration, Neubildung der Zementzellen auf der Wurzeloberfläche und der Ausbildung eines neuen parodontalen Faserapparates kommen. Der Zahn wird dadurch wieder fest im Knochen verankert – so wie es die Natur vorgesehen hat.
Außerdem lassen sich mit Emdogain durch zurückgezogenes oder verletztes Zahnfleisch freigelegte Wurzeloberflächen im Rahmen eines kleinen chirurgischen Eingriffs wieder bedecken. Je nach Schweregrad der sogenannten Rezession kann der Defekt wieder bis zu 100% abgedeckt werden. Auch hier kommt es wieder zu einer Regeneration des parodontalen Zahnhalteapparates.